U nekim zemljama postoji zahtev da se vrši 'kalibracija', odnosno verifikacija merenja. Operater mora obezbediti da sve sonde uređaja budu na istoj temperaturi, bliskoj radnoj temperaturi (50° - 60°C). To se može obezbediti specijalizovanim kalibratorom ili priručnim sredstvima. Na primer, može se koristiti veća posuda sa zagrejanom vodom. Sonde se postave u centar posude, zajedno sa sondom referentnog termometra. Potrebno je uz mešanje vode sačekati desetak minuta da se temperature na sondama stabilizuju.

Aplikacija omogućava kontrolu ovog procesa. Operater pritiskom na dugme Start kalibracije otvara panel na kome može da podesi temperatura koju pokazuje referentni termometar. Dugme se nalazi u donjem desnom uglu prozora komore, na status baru.

Status bar prozora komore prikazuje i datum zadnje kalibracije i utvrđenu minimalnu temperaturu sterilizacije.

Nakon toga u aplikaciji treba podesiti vrednost temperature koju pokazuje referentni termometar i pritisnuti dugme KALIBRACIJA.

Aplikacija na osnovu izmerenih temperatura na sondama određuje novu minimalnu temperaturu tretmana. Nova minimalna temperatura tretmana se pomera za razliku maksimalne temperature na MKS uređaju i temperature referentnog termometra i zaokružuje na prvu veću celobrojnu vrednost.
Postoje i sledeća ograničenja, sve aktivne sonde moraju biti priključene i njihovo pokazivanje mora biti u opsegu ±5°C od pokazivanja referentnog termometra.
Ukoliko nakon kalibracije dodate još neku sondu i aktivirate je ta kalibracija više neće biti validna.
Podatak o zadnjoj izvršenoj i validnoj kalibraciji se prikazuje na izveštaju o izvršenoj sterilizaciji.

Prikaz informacije o kalibraciji se može prikazati/sakriti iz prikaza na ekranu i na izveštajima. To se radi desnim klikom na status bar gde je prikazana kalibracija. Otvara se iskačući prozor gde se može dozvoliti/zabraniti prikaz kalibracije.